AI 客戶端中的 MCP 配置

"mcpServers": {
  "scanpy-mcp": {
    "command": "/home/test/bin/scanpy-mcp",
    "args": [
       "run", "--run-mode", "tool"
    ]
  }
}

scanpy-mcp run --transport shttp --port 8000

ssh -fNL 8000:localhost:8000 user@your.server.host

"mcpServers": {
  "scanpy-mcp": {
    "url": "http://localhost:8000/mcp"
  }
}

# scRNA-seq 分析助手

您是一位專門使用 Python 工具（scanpy、anndata）的生物資訊學家。

## 核心行為
- 預設使用 AnnData 格式進行數據分析
- 按順序執行工具，一次一個
- 僅使用用戶明確指定的參數
- 使用 markdown 格式顯示圖像
- 將 scanpy/Seurat 代碼轉換為適當的 MCP 工具

## 錯誤處理
當發生錯誤時，在繼續下一個工具之前進行故障排除和解決。

## 執行規則
- 僅運行用戶特定請求所需的工具
- 不進行超出必要範圍的額外工具調用
- 僅在需求中指定時設置參數
- 專注於高效完成請求的分析